Pemanfaatan obat-obatan tradisional tidak dapat dipisahkan dari lingkungan masyarakat Indonesia. Oleh sebab itu, sebagai area konservasi, Kebun Raya Bogor juga memiliki Taman Tumbuhan Obat yang terdiri dari beragam jenis tumbuhan. Sampai saat ini tumbuhan obat di dikonservasi di dua area XXIV.A dan XXIV B. Koleksi tumbuhan obat di XXIV.A berjumlah 175 jenis yang terdiri dari 55 suku dan 144 marga. Sedangkan koleksi tumbuhan obat di vak XXIV.B. sebanyak 228 jenis, terdiri dari 65 suku dan 172 marga.

Tumbuhan obat tersebut dikelompokkan ke dalam 11 kelompok pemanfaatan, yaitu permasalahan kulit dan kelamin, pernapasan, aromatic, mulut dan pencernaan, otot dan tulang, organ dalam, afrodisiak tonikum dan stimulant, permasalahan kewanitaan, penawar racun, obat deman, dan anti kanker.

Taman Tumbuhan Obat berada dalam satu kawasan dengan Taman Orchidarium, Taman Anggrek Hitam dan Taman Kopi