Taman ini difungsikan untuk mengkoleksikan berbagai jenis tanaman paku-pakuan. Taman Paku Kebun Raya Cibodas terletak di vak I.C dan hingga saat ini telah mengoleksikan 101 jenis ( Data Januari 2015 ) yang berasal dari berbagai daerah di Indonesia. Beberapa manfaat tumbuhan paku antara lain sebagai bahan pangan, tanaman hias, kerajinan tangan dan untuk obat tradisional. Paku-pakuan di Indonesia telah lama digunakan masyarakat sebagai bahan baku obat tradisional, sebagai contohnya adalah rambut-rambut halus pada paku kidang Dicksonia blumei (Kunze) Moore dan paku simpai Cibotium barometz (L.) J.Sm. yang dipercaya sebagai obat luka untuk menghentikan pendarahan.